用自制生物传感器检测葡萄糖 4/5 - 迈克尔斯-门顿动力学

本章是 "利用基于葡萄糖氧化酶的自制生物传感器检测葡萄糖 "系列的一部分。在本章中,我们将讨论迈克尔斯-门顿理论及其对生物传感器的重要性。最后一节讨论线性-布尔克曲线图。

迈克尔斯-门顿常数

要确定生物传感器的特性,Michaelis-Menten 常数是一个重要因素。要了解它的重要性和来源,就必须了解 Michaelis-Menten 的观察和理论。这一模型仍然是酶动力学中最常用的模型。酶 E 是一种催化剂,可将底物 S(酶转化的试剂)转化为产物 P 或多种产物。要进行底物选择性反应,底物和酶必须形成复合物 ES。可以假定 ES 的浓度与酶 E 和底物 S 处于动态平衡状态。该反应的限制步骤是 ES 向 E 和 P 的转化,通常产物一方的平衡非常强。酶促反应用以下公式表示

公式 3.1

根据质量作用定律,复合物的解离常数KS

公式 3.2

虽然从复合物到产物的反应可视为不可逆反应,但 ES 的形成动力学比产物的形成快,是可逆的。因此,反应速度vR与酶-底物复合物的浓度成正比。

公式 3.3

ES 的浓度取决于酶和底物的浓度。如果我们有固定量的酶溶液,并在增加底物浓度时观察速度,就会观察到饱和曲线(见图 3.1)。这是因为随着底物浓度的增加,更多的 E 转化为 ES。在某一点上,所有的 E 都转化成了 ES,再添加底物也不会产生更多的 ES。

一个行之有效的比喻是,一家超市的所有收银台都是开放的。如果有 5 个收银台和 2 个顾客,2 个顾客可以在 30 秒内付款。如果顾客数量增加到 5 个,5 个顾客可以在 30 秒内付款,即速度vR(每次结账的顾客数量)增加。更多的顾客,例如 10 个,不会增加vR,但结账处会出现排队现象。

图 3.1 | 以速度 v 转化底物 S 的定量酶饱和曲线

最大速度vmax和具有vmax的最低浓度([S]max)是两个包含重要信息的参数。反应速率或速度 v 决定了 S 转化为 P 的频率,从而决定了电子转移到酶的频率。由于这些电子将直接或间接地捐献给电极或被电极接受,因此测量过程中的反应速率由测量到的电流表示。这意味着vmax越高,单位浓度的电流就越大,也称为灵敏度。[S]max决定了电流取决于 [S] 的浓度范围。如果[S]max很高,则该酶可检测的浓度范围就很大。如果酶被固定,[S]maxvmax与自由扩散时的特性相比可能会发生变化。

然而,确定这些重要参数非常困难。引入迈克尔斯-门顿常数KM 可以简化这一问题。由于饱和度的形状,vmax很难确定,因此可以使用 0.5vmax作为参考,而不是使用 vmax。根据上一段讨论的 ES 和vR之间的关系,如果 v 为 0.5vmax,则酶总量的一半作为 ES 存在。如图 3.1 所示,0.5vmax 时的[S]浓度即为迈克尔斯-门顿常数KM。迈克尔斯-门顿常数KM表明底物 S 与酶 E 之间的亲和力有多高。此外,KMvmax的值还可以用 Lineweaver-Burke-plot 来确定。

确定 KM 和 vmax

在了解了KM为何重要之后,我们还可以通过解方程 3.2 发现迈克尔斯-门顿常数KM的另一个有趣性质,即:"......"。

公式 3.4

从上一章我们可以知道,此时酶Et总量的一半转化为 ES:

公式 3.5

将公式 3.4 和 3.5 插入公式 3.2,我们会发现

公式 3.6

酶的复合常数KS就是迈克尔斯-门顿常数KM,因为在特殊情况和一般情况下,常数是相同的。为了找到测量KM 的方法,我们需要研究一般情况下的方程 3.2,即任何 [S] 值,并将其与测量到的电流联系起来。正如我们在前一章中所知道的,电流取决于反应速率vR。根据公式 3.3,我们已经知道vR和 [S] 之间的联系,并且可以推导出与更有趣的vmax 之间的联系,因为当所有酶都转化为 ES 时,就达到了vmax

公式 3.7

方程 3.7 显示了这一结论。将方程 3.6 与 3.2 结合使用,可以得到 [ES] 的新表达式(方程 3.8)。

公式 3.8

我们的目标是得到一个表达式,其中包含我们感兴趣的所有参数以及我们可以通过测量确定的参数。方程 3.8 不包括vR,我们需要它来与我们的测量建立联系,因为它与电流相关。将方程 3.3 中的 [ES] 代入方程 3.8,即可引入缺失的vR

公式 3.9

在安培测量过程中,我们可以控制底物 [S] 的浓度,测量vR即电流 I。方程 3.9 中的未知值就是我们要评估的两个值:vmaxKM。科学家们喜欢将方程转化为线性形式,因为这通常可以通过线性拟合很好地确定缺失的参数。如果将方程 3.9 倒置,就可以得到线性形式:

公式 3.10

公式 3.10 被称为 Lineweaver-Burk 方程。根据 Lineweaver-Burk 方程,1/vR与 1/[S]的关系曲线应为交点为 1/vmax、斜率为KM/vmax 的直线。这样的曲线图称为 Lineweaver-Burk 曲线图,但在安培实验中,1/I 与 1/[S] 的关系曲线图(见图 3.2)。

图 3.2 | 斜率 m 和交点 b 的 Lineweaver-Burk 图方案

了解 Michaelis-Menten 常数KM还有另一个好处。从图 3.1 中可以看出,开始时的饱和曲线接近于线性关系。通常情况下,定量测量需要在曲线的这一段线性范围内进行。可以将KM 浓度以下的曲线视为线性关系。如果 Michaelis-Menten 常数是已知的,那么生物传感器的线性范围也是已知的。KM的典型值在 10-2- 10-6 摩尔/升之间。